碳是所有生命形式的基石。碳、氮、水、氧，是肥料的基本组成部分。
原料垫层碳（秸秆、稻壳）用于吸附并保持可溶性氮及堆肥中的其他植物营养元素。
碳源材料为堆肥提供结构和孔隙度，使堆肥能够“呼吸”，让氧气在堆肥中流动。如果没有氧气，有机物质分解将很快转为厌氧过程。
碳源材料为堆肥中的微生物提供维持生命所需的碳水化合物。分解堆肥的细菌也需要蛋白质和碳水化合物来生长繁殖：粪便组分为微生物提供蛋白质（氮），碳源材料提供碳水化合物以维持其代谢。
畜禽粪便中的氮，来源于饲料中的豆粕及肠道中的酶促反应。
最初氮以尿素形式存在、极易溶解，暴露于空气后，天然尿素酶会将其转化为氨气（NH3）和氮气（N2）。氨是挥发性气体。如果没有捕获尿素和氨的机制，堆肥中大部分天然氮的价值会损失或浪费。
绿康源好氧堆肥通过将可溶性和挥发性的氮转化为与有机碳结合的“有机”氮，减少有价值氮素的损失。堆肥完成后，有机氮保留在分解微生物的细胞结构内，氨氮消失、气味减少，可溶性氮转化为缓释氮（SRN）。
当碳（原始有机物质）和氮气充足时，好氧微生物开始快速生长和繁殖，并以有机质为食。 随着微生物活动的增加，嗜热微生物的代谢过程通过呼吸产生大量的生物热。 这种热量以水蒸气的形式释放。
微生物高度活跃，内部堆肥温度为55至60摄氏度。
最终，堆温降低、料堆变干，微生物分解活动减慢并逐步停止——但这一减慢不等于堆肥已经稳定。整个过程中需反复补充水分，微生物群落才能完成充分稳定的分解。
绿康源堆肥场收集的雨水会定期回收到料堆中。堆肥湿度保持在45%—55%时，堆肥过程最佳。低于45%时堆料活性降低、分解减缓；水分过多则会阻碍曝气，可能导致厌氧。
有机物必须以稳定的腐殖质形式转化。过程中可溶性氮转化为有机氮和缓释氮。氮由细菌生物质固定，施入土壤后经微生物活动分解为植物可利用的形式。施肥应在植物最需要的时候进行，而不是过早、过晚或完全不施。将氮和有机物（碳）转化为绿康源肥料，需要时间、氧气和水。
